Cryo-EM Uppsala
Kontakt
Cryo-EM Uppsala erbjuder skräddarsydda lösningar för alla användare, oberoende av tidigare erfarenhet. Kontakta oss på: cryoem-icm@uu.se
Anna Sundborger-Lunna, PhD, Föreståndare
anna-sundborger-lunna@icm.uu.se
Tel: 076-0472807
Daniel Larsson, PhD, Kryo-EM expert
daniel.larsson@icm.uu.se
Tel: 018-471 4601
Utrustning och tjänster
Cryo-EM Uppsala möjliggör kryo-EM-arbetsflödet för partikel analys (single particle analysis).
Prov preparation
Utvärdering av prover och datasamling
Ett 200kV Glacios elektronmikroskåp med en Falcon III direkt elektrondetektor finns tillgängling för effektiv snabb-analys av vitrifierade gridder samt för datasamling. Elektronmikroskåpet är utrustat med en autoloader som möjliggör analys av upp till 12 prover under 3 dagar. Falcon III elektrondeterktorn samlar ca 40 filmer/timmer beroende på prov samt inställningar.
Dataanalys och 3D rekonstruktion
Cryo-EM Uppsala get möjlighet till direkt-analys av data under insamling för optimering av prover. Vi erbjuder även infrastruktur för 3D rekonstruktion och modell-byggande med hjälp av olika mjukvarupaket, inklusive Cryosparc, Relion, COOT och Chimera.
Start ett nytt project/Boka prepration och analys
Cryo-EM Uppsala erbjuder skräddarsydda lösningar baserade på projektets mål samt användarens tidigare erfarenhet av kryo-EM. Fyll i blankett(er) och skicka till: cryoem-icm@uu.se
- För att påbörja ett nytt projet: Projektformulär PI-formulär
- För att komma igång med prov preparation: (VitroBot): Vitrobot-formulär
- För att komma igång med prov analysis (Glacios): Glacios-formulär
Utbildning
Cryo-EM Uppsalas mål är att tjäna både nya och erfarna kryo-EM-användare vid Uppsala universitet med omnejd. Erfarna användare kommer att få möjlighet till självständigt arbete efter en kort introduktion, medan nya användare kommer att erbjudas kurser (Intro till kryo-EM), workshops och andra utbildningstillfällen. Vänligen kontakta oss på cryoem-icm@uu.se för mer information!
Kostnad
Kontakta oss för information om hur man bokar instrumenten. Avbokning senast 24 h innan start.
VitroBot
- 200 SEK/tillfälle (exklusive kostnad för griddar)
Glacios
- Dag: 2500 SEK (6 timmar mellan 9.00 och 15.00)
- Natt: 2500 SEK (18 timmar mellan 15:00 och 9:00 dagen efter)
- Datasamling över helg: 2500 SEK / 24 h
Rabatter på användning av mikroskopet för olika användargrupper:
- Institutionen för cell- och molekylärbiologi vid Uppsala universitet: 20%
- Fakulteterna TekNat och MedFarm vid Uppsala universitet: 10%
- Andra akademiska användare: 5%
TillkännagivandeN
All utnyttjande av faciliteten för provberedning, screening, datasamling, data processning och konsultation ska tillkännages i samband med publiktation. Vänligen inkludera detta stycke:
We acknowledge the use of the Cryo-EM Uppsala facility for [include the services used here], funded by the Department of Cell and Molecular Biology, the Disciplinary Domains of Science and Technology and of Medicine and Pharmacy at Uppsala University.
SLACK
Du hittar oss här: cryo-emuppsala.slack.com (kontakta oss för att få en inbjudan)